综合服务部
综合服务平台是国家植物标本资源库为优化支撑团队，服务科学研究组建的技术支撑平台之一。负责标本制作、分科鉴定、国际交换、科学绘图、科普宣传、网站运维、运行保障等工作内容，是标本馆科技支撑的重要窗口。
标本管理部
标本管理部主要负责300万份腊叶标本、40万份苔藓标本、8万份种子标本以及7万份化石标本的进出管理、入库归位和日常管理工作。同时，主管负责标本的数字化工作。
植物图像与智能识别平台
植物图像与智能识别平台在系统收集传统影像资料的基础上，通过搭建网站平台收集各类植物图像，已收录各类植物图片近800万幅，涉及近500科5400属40000种（含品种），涵盖了中国维管植物种类的三分之二；创建了集数据挖掘与深度学习智能识别于一体的物物种智能精细鉴定体系；已实现2万种植物的图像智能识别，TOP5识别准确率在85%以上；开发了“花伴侣”“花伴侣专业版”等植物识别APP应用产品，服务于物种资源普查、国门生物安全与生物多样性保护等国家需求。
植物物种信息与大数据平台
植物物种信息与大数据平台以既往工作（数据）积累为基础，瞄准学科发展和国家需求，建设和完善以名称及标本为核心的国家型植物物种综合信息系统/平台，为植物分类学、生物多样性保护及植物资源挖掘与利用提供科学支撑和技术服务。构建集标本、名录、评估三位一体的大数据平台。
植物 DNA 与分子鉴定平台
植物 DNA 与分子鉴定平台是目前世界上最大的植物DNA库，装备先进的分子鉴定相关仪器设备。平台科研人员倾全力建设DNA库的同时，开展了一系列的分子鉴定技术研究，技术水平处于国际领先地位。历经数年，平台利用DNA库材料建设了植物DNA条形码参考序列数据库，在植物材料的物种鉴定、品种鉴定、原产地溯源和科学研究等方面发挥重要作用，为公安、海关、政府、企业和社会个人提供了大量的植物鉴定服务，为我国植物资源保护与安全利用等提供了可靠的鉴定技术支撑。
植物形态与结构平台
植物形态与结构平台主要在植物超微结构、亚细胞、细胞、组织和器官等层次上开展深入细致的观测研究，在设备配置、观察手段和研究方法等方面持续保持着领域内的国际先进地位。拥有植物组织制片设备、各类生物显微镜、显微CT扫描系统、高内涵成像系统、扫描电子显微镜、冷冻型高分辨扫描电子显微镜、多光谱成像、3D数码显微镜等，能够从多功能、多尺度观察和记录各种植物细胞、组织和器官的静动态形态结构特征的大型先进仪器。
植物分子生物学平台
植物分子生物学平台能够进行核酸蛋白等生物大分子的前处理、检测、功能分析，并为后续高通量测序提供前端准备。为相关研究提供最基础的技术支撑。具备流式细胞仪、气质联用触角电位检测系统、毛细管电泳仪、荧光定量PCR仪、高速、亚超速、超速离心机等分子生物学相关仪器设备。
植物基因组与生物信息学平台
植物基因组与生物信息学平台主要针对重要资源植物以及植物进化历程中的关键类群，利用全基因组数据完成植物分类与资源保护和利用、生命之树的重建、适应性进化和保护遗传学以及进化发育与基因组学等领域的工作。本平台主要包含了高通量测序设备和与之相匹配的高性能计算设备，可提供基因组、转录组、表观遗传组水平的测序服务，为组学大数据的产生、分析提供支撑服务。
植物栽培与功能研究平台
植物栽培与功能研究平台负责各研究课题所需野生植物材料的栽培、迁地保护、人工杂交实验等工作，提供形态学、解剖学、细胞学、孢粉学、胚胎学和分子系统学等实验所需的活体材料。科研温室目前有玻璃温室560平方米，人工气候室20平方米；主要栽培有苏铁科、金粟兰科、马兜铃科、毛茛科、芍药科、苦苣苔科、茄科、禾本科、百合 科及兰科等植物材料。
