国家级奖励
国家自然科学一等奖
1) 王文采、汤彦承及研究集体,中国高等植物图鉴及中国高等植物科属检索表,1987。
2) 秦仁昌,中国蕨类植物科属的系统排列和历史来源,1993。
3) 钱崇澍、陈焕镛、吴征镒、王文采等及研究集体,《中国植物志》的编研,2009。
国家自然科学二等奖
1) 钟补求,马先蒿属的一个新系统,1956。
2) 俞德浚,陆玲娣,谷粹芝,关克俭等,中国植物志第36、37、38卷(蔷薇科),1989。
3) 石铸,中国菊科蓝刺头族、莱蓟族及菊苣族系统分类与区系, 1999。
4) 陈心启,吉占和、朗楷永,罗毅波,朱光华,中国兰科植物研究,2002。
国家自然科学三等奖
1) 汪发缵,唐进,陈心启,梁松筠,戴伦凯,汤彦承等,中国植物志第14,15卷(百合科),1987。
2) 钟补求,洪德元,杨汉碧,郑斯绪等,玄参科植物的分类和系统学,1991。
3) 徐仁、李承森,耿宝印,中国华南早期维管植物的起源与演化,1997。
4) 应俊生,张玉龙,张志松,李良千,中国种子植物特有属,1999。
国家自然科学四等奖
1) 张金谈,张玉龙,席以珍等,中国热带亚热带被子植物花粉形态,1989。
中国科学院奖励
中国科学院自然科学一等奖
1) 秦仁昌,中国蕨类植物科属的系统排列和历史来源,1989。
2) 应俊生,张玉龙,张志松,李良千,中国种子植物特有属,1997。
3) 陈心启,吉占和、朗楷永,罗毅波,朱光华,中国兰科植物研究,2001。
中国科学院自然科学二等奖
1) 王文采,潘开玉,李振宇,东亚苦苣苔科植物分类与系统,1993。
2) 徐仁,李承森,耿宝印,中国华南早期维管植物的起源和演化,1994。
3) 张玉龙,席以珍,张金谈,高桂珍,杜乃秋,中国蕨类植物的孢子形态,1997。
中国科学院自然科学三等奖
1) 洪德元,廉永善,桔梗科植物分类,1989。
2) 吴鹏程,罗健馨,汪楣芝,中国苔藓植物区系的特性及其形成和地理分布规律,1965。
3) 胡雨帆等,新疆二叠纪、三叠纪植物化石及其区系意义,1996。
中国科学院科技进步一等奖
1) 俞德浚,陆玲娣,谷粹芝,关克俭等,中国植物志第36,37,38卷(蔷薇科),1987。
2) 王伏雄,陈祖铿,胡玉熹,常永祯,李芝莉等,裸子植物胚胎学与解剖学,1988。
中国科学院科技进步二等奖
1) 汪发缵,唐进,陈心启,梁松筠,戴伦凯,汤彦承等,中国植物志14,15卷(百合科),1986。
2) 钟补求,洪德元,杨汉碧,郑斯绪等,中国植物志第67卷2分册、68卷(玄参科),1988。
3) 陈艺林,石铸,中国菊科植物系统分类和区系,1998。
4) 匡可任、路安民,吴征镒等,中国茄科植物,1988。
中国科学院科技进步三等奖
1)洪德元,婆婆纳族(玄参科)的分类与进化、兼论孢粉学,1986。
2)张金谈,张玉龙,席以珍,刘丙伦,中国孢粉形态专科专属研究,1986。
3)王文采等,中国植物志27,28卷(毛茛科),1986。
4)陈明洪,孔昭辰,陈晔,川西高原第三纪植物群的发现及在植物地理学上的意义,1987。
5)路安民、陈书坤,张志耘,吴征镒,陈宗莲,中国葫芦科植物,1988。
6)陈心启,李娇兰,朱相云,张志耘,李奕,中国植物系统学文献要览,1998。
中国科学院重大科技成果二等奖
1)吴鹏程,罗健馨,郭木森,中国藓类植物属志(上、下册),1985。
2) 张金谈,张玉龙,席以珍等,中国热带亚热带被子植物花粉形态,1985。
3) 陈心启,唐进,四个原始兰科新属的发现及其在系统发育上的重大意义,兼论中国兰科植物区系,1985。
4) 徐仁,朱家楠,陈晔,段淑英,胡雨帆等,中国晚三叠世宝鼎植物群,1985。
中国科学院重大科技成果三等奖
1)孙湘君,杜乃秋,中国晚白垩-第三纪孢粉区系及植物发展的研究,1980。
2)应俊生,马成功,张志松,鄂西神农架地区的植被和植物区系,1980。
其他奖项
1)李振宇,中国科学院青年科学家一等奖,1990年。
2)王文采,求实科技基金会:杰出科技成就集体奖励-生物志奖,1996。
3)李振宇,李良千,傅徳志,覃海宁等,广西九万山野生植物资源考察研究,获广西科技进步三等奖,1996。
4)汪小全,中国科学院院长奖学金特别奖,1997。
5)王文采,何梁何利基金科学与技术进步奖,1997。
6)汪小全,全国优秀博士学位论文奖,1999。
7)洪德元,全国优秀博士生导师奖,1999。
8)罗毅波,中国科学院院长奖学金特别奖,1999。
9)洪德元,何梁何利基金科学与技术进步奖,2000。
10)葛 颂,中国科学院青年科学家科学创新奖,2001。
11)刘健全,全国优秀博士学位论文奖,2001。
12)系统与进化植物学重点实验室被国家人事部和中科院评为2001年度中国科学院“先进集体”。
13)路安民,被教育部、国务院学位委员会授予全国优秀博士学位论文指导教师,2001。
14)宋葆华,中国科学院院长奖优秀奖,2002。
15)路安民,中国科学院宝洁优秀研究生导师奖,2002。
16)葛颂,上海市科学技术一等奖,2009。