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实验室已成为我国系统与进化生物学研究领域的重要研究力量，同时也是国际上该领域有影响的实验室之一。主持的获奖成果包括国家自然科学二等奖1项、中国科学院自然科学一等奖1项、北京市科学技术二等奖1项目，中国科学院青年科学家科学创新奖1项，全国优秀博士学位论文奖1项，以及其他奖 5项。实验室所取得的研究成果还体现在所发表的一系列具有国际影响的研究论文方面。
近五年来，实验室已取得了一批研究成果，包括主持和参与《中国植物志》和Flora of China（英文版中国植物志）的编撰；参与出版了《中国被子植物科属综论》、《中国苦苣苔科植物》等一系列重要著作。主持的获奖成果包括国家自然科学二等奖1项、中国科学院自然科学一等奖1项、北京市科学技术二等奖1项，中国科学院青年科学家科学创新奖1项，全国优秀博士学位论文奖1项，以及其他奖 5项。实验室5年来共发表研究论文370篇（SCI收录241篇），其中实验室为第一署名单位的论文274篇（SCI收录189篇）；专著37部。有15篇论文作为第一署名单位发表在Mol Biol Evol, Mol Ecol, Genetics, Plant Physiol, Mol Phylogenet Evol, FEBS Letter, Biochimie, New Phytol等具有国际重要影响的刊物（SCI影响因子大于3），近5年发表的主要论文被SCI论文他人引用202次
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近五年来主持的重要获奖成果两项：
1）“中国兰科植物研究”（陈心启等）
2001年获中国科学院自然科学一等奖，2002年获国家自然科学二等奖。该成果包括以下内容：1）五部兰科专著约340万字；2）四部国际（美国、英国、日本）合作完成的著作；3）发表有关系统、分类、区系、地理、性的分化、传粉机制以及新属新种等论文101篇。
本成果基于20多年的野外工作，亲自采集和泡制了大量的标本，观察和拍摄了一万余张彩色照片。同时，多次赴英、美、法等国核对模式标本和收集文献资料，并将保藏于日本的台湾兰科模式标本全部拍摄带回，且两次赴台进行研究。在此基础上编著完成的五部兰科专著，其精确性与科学性均达到世界先进水平，其中一部被国际评为已出版的同类著作中最高水平者。在国际合作完成的4本著作中，Orchid Biology的有关章节受到American Scientist等5个国际刊物的高度评价。CITES ORCHID CHECKLIST（I, II）则是兰科保护方面国际公认的权威性文献。
该成果的101篇论文包括：提出了兰科的新系统、杓兰属新系统、独蒜兰属新命名系统；完成了4个属的世界性专论；发表了4个新属和100多个新种，其中进兰属、无喙兰属等原始新属以及麻栗坡兜兰和暖地杓兰等2个新种是国际公认的学术上重大发现。前者发表后曾受到研究兰科理论的Rasmussen的高度评价，并在专著中多次引用；后者不仅被反复引用，而且被国外杂志全文转载并翻成英文和德文；创立Tanaka-Kaiyong Line（田中——楷永线），被认为是东亚植物区系重要分界线；发现Satyrium两性型和单性型并存，以及通过研究Hemipilia传粉机制，发现了食源性欺骗传粉，并找出传粉昆虫及其真正食源植物，两者均为新发现和亚洲首次研究和报告。该成果为我国兰花植物资源的可持续利用和开发打下了扎实的基础，提供了最基本的重要资料。
2）“中国新生代重要植物类群演化和古环境定量重建”（李承森等）
2005年获北京市科学技术二等奖。在中国新生代植物研究在植物区系的调查和研究基础上，该研究围绕重要植物类群演化和古环境重建研究，发现和研究一系列具有重要科学价值的新生代植物类群，为深刻理解东亚北美植物间断分布等重大科学问题提供直接证据；首创定量分析古气候变化新方法——“特有种气候分析法”，是利用化石植物和现代植物定量研究古气候的突破；在国际上首次提出水杉古地理分布范围的变迁与新生代全球气候变冷过程相一致的新观点；在国际上首次通过银杏气孔参数的研究确认其对大气CO2 浓度变化敏感，揭示2 亿年以来长时间尺度古大气CO2 浓度变化过程，首次采用叶相分析和共存分析的生物学方法定量研究古环境并获得气候参数；运用生物学思想和方法定量研究古环境和古气候产生了生物科学、环境科学和地球科学交叉的新学科生长点——古环境生物学。研究结果已被包括PNAS在内的国际重要刊物多次引证并正面评述
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该项成果对认识全球陆地生态环境的重大变化，植物演化及其与环境演变的内在联系具有重要科学意义，对人类保护和可持续利用植物资源具有指导意义。该项成果在Amer J Bot、Bot J Linn Soc, Intern J Plant Sci和Palaeogeo, Palaeoclim, Palaeoecol等重要SCI刊物上发表12 篇研究论文，国内外核心刊物上32 篇。
 获奖成果
代表性研究成果
发表论著
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